정부에서는 지식기반 경제로의 진입에 따라 ‘산·학·연 협력 활성화’를 통한
새로운 성장 동력 창출과 국가경쟁력 강화를 위한 대학의 역할 증대에 따라 대학의 연구기반 개발, 기술이전, 창업 등
산학협력을 체계적으로 관리·지원하기 위하여 대학 산학협력의 전담 추진 기구로써 산학협력단을 설립·운영할 수 있도록 하였다.

이에 따라 산학협력단 설립·운영 근거 마련을 위하여 ‘산학협력단 회계처리 규칙(2003)’을 제정하였고
‘예산편성 및 재정운영 유의사항(2004)’ 에 의하여 정부의 대학지원금은 산학협력단을 통하여 관리·운영하도록 하였다.

이에 서울벤처대학원대학교는 산학협력을 통한 산학공동 연구 활성화 및 연구 성과 사업화 확대를 위하여
산학협력 전 구성과 사업화 확대를 위하여 산학협력 전담기구로서 법인격을 갖는 산학협력단을 설립하였다. 이는 학문적 자본의 도입에 따라
종전의 기초연구와 학문적 명성에 의한 대학발전 전략에서 발전하여, 연구중심대학으로써 산학협력 활성화를 통한 국가경쟁력 강화에 있어
본교의 역할을 재정립함으로써 이에 적극 대처하고자 하였다.